Completa su palmarés oficial con trece Campeonatos Regionales y cuatro Campeonatos Provinciales, a nivel local. Todo pintaba bien en el inicio de Libertadores, pero el equipo fue decayendo su nivel futbolístico, donde cayó derrotado en el resto de sus presentaciones ante Fluminense de Brasil y Arsenal de Sarandí, este último conllevó a la destitución de Oscar Gil como DT, donde solo pudo sumar un punto (en la primera jornada) frente a Boca. Este hecho y la situación de crisis tanto deportiva como económica del primer equipo, hizo que el acuerdo de filialidad ya no se renovase más. Además, debido a su carácter feroz y su reputación de competidor ganada a pulso, a menudo entraba en altercados verbales con árbitros, recibiendo más multas y siendo más veces expulsado del partido que cualquier otro entrenador en la historia de la liga. Fue además el último torneo para Moisés Villarroel, ya que se retiró en marzo de ese año, jugando por su club formador Santiago Wanderers, después de un partido contra Unión Española. Cuando se bajó vio que pocos reaccionaban y todos presentaban cuadros de intoxicación, llegaron a una posta médica y les dieron ayuda; se salvaron «de una buena», relató el utilero del club en los últimos 34 años.
Por su parte, las piezas con estampados referentes a My Hero Academia se puede observar una gráfica que muestra al grupo de villanos: Tomura Shigaraki, Twice, Himiko Toga y más. La temporada 2013/14 en Primera División Regional Aficionados, replicas camisetas futbol el equipo tiene la base de jugadores jóvenes que consiguieron el ascenso el año anterior. Durante la temporada 2009/10 quedó en la 1.ª posición de la Primera Nacional «A» y jugó, posteriormente, el play-off de ascenso contra el filial del F. C. Barcelona; siendo eliminado en su intento de conseguir el ascenso a la División de Plata. 1929: 2.º posición en el Campeonato de Primera División. En 1983 obtuvo su 11.º título de Primera División. El 4 de mayo de 2020, el club suscribe un acuerdo de filialidad con el Burgos Promesas que compite en la Tercera División. Adicionalmente, es el equipo que más trofeos posee del Campeonatos de España de Aficionados con un total de ocho. ↑ «Ya es oficial: Julián Calero, nuevo entrenador del Burgos CF». Para la temporada 2012/13, el Burgos Club de Fútbol decidió no inscribir al equipo para que hubiera competido una temporada más en la Segunda División B. Problemas deportivos por la ausencia de varios jugadores importantes que ya habían comunicado que no iban a continuar y sobre todo problemas económicos ante la bajada de subvención por parte del patrocinador y del ayuntamiento, hicieron que la sección desapareciese.
2003/04 en última posición, lo que significaba su descenso a Football League One (tercera categoría). En la temporada 2011/12, tras la renovación por un año más del acuerdo de filialidad firmado entre ambos clubes en el verano de 2010, el equipo filial bajo la denominación de Burgos B Bupolsa, quedó en el puesto 16.º del grupo VIII de la Tercera División. Tras 4 temporadas entre la Regional Ordinaria y la Regional Preferente y tras dos ascensos, compite finalmente en la Tercera División durante las temporadas 2006/07 y 2007/08. El equipo desaparece en esta última temporada después de descender a Regional Preferente y el club no poder mantenerle en esa categoría. Tras otra gran reestructuración en el verano de 2011 y con el cambio de nombre además de las distintas categorías por parte de la Liga Nacional de Fútbol Sala, el equipo queda encuadrado para la temporada 2011/12 en el grupo 2 de la ahora llamada Segunda División B. El presidente del Burgos CF anuncia que la sección de fútbol sala debe autofinanciarse para poder competir. Plantel de Nacional, campeón de la Copa Libertadores 1988 y que un año después ganaría su tercer Copa Intercontinental. Tras un verano en el que se pensaba que la sección iba a desaparecer, el club se inscribe en la categoría gracias a la renovación por un año más con el patrocinador Hotel Ciudad de Burgos.
El equipo queda en el puesto 11.º del grupo consiguiendo el objetivo de la permanencia un año más. La temporada 2010/11 y tras sufrir la categoría Primera Nacional «A» una gran reestructuración, el equipo consigue acabar en un meritorio 5.º puesto y mantenerse una temporada más en una categoría que la Liga Nacional de Fútbol Sala quería semi-profesionalizar. El inicio de temporada mantiene la misma tónica que la anterior, aún cambiando de categoría y con una gran renovación de jugadores en la plantilla. Se trata de una taza de gran calidad, tanto materiales y acabados, como en la calidad de su serigrafia. Para la campaña 2013-2014, tanto de la Serie A, como Liga de Campeones, el Milan sigue con su nuevo modelo e incorpora, con poco gasto, a Andrea Poli, desde la Sampdoria (a cambio del 50% de la ficha del defensa polaco Bartosz Salamon, y Riccardo Saponara, proveniente del Empoli de la Serie B, también llegaría cedido desde el eterno rival, el Inter de Milán, el defensor argentino Matías Silvestre. 1983: Campeón de la Liga Distrital del Cuzco.