Regresaron a la primera en la temporada 2005-06 y fueron progresando hasta que en 2012 fueron subcampeonas de la Bundesliga. Así, el equipo femenino recién fundado del 1. FC Köln logró comenzar en la 2. Bundesliga Süd en la temporada 2009-10. El equipo jugó con la parte superior derecha desde el principio, camisetas de futbol pero a menudo tuvo que admitir la derrota en los años siguientes y se perdió el salto a primera clase.
